细胞是生物体的基本结构和功效单元，包罗真核细胞和原核细胞两种。两种细胞最大的区别在于真核细胞有核和其他细胞器，而原核细胞没有，只有核区和细胞质。下面将从结构、代谢和生态方面划分先容两种细胞的区别。
结构区别
真核细胞内部结构庞大，包罗细胞膜、细胞壁、核膜、染色体、线粒体、内质网、高尔基体、溶酶体等许多细胞器。
而原核细胞由于没有核膜和其他细胞器，以是相对对照简朴。普遍存在的结构主要有细胞壁、核区、线粒体、质粒、原核核糖体、鞭毛（或纤毛）、荧光素等。
代谢区别
真核细胞由于功效完整，繁殖速率慢，而代谢也相对缓慢，依赖氧气的呼吸和线粒体代谢发生的ATP，以及其他细胞器的协同作用来完成差异的生物历程。
原核细胞由于没有其他细胞器的协同作用，代谢方式相对单一，因此有相当多的机制具有特异性，例如发生氢化物、甲烷、硫酸盐起始举行呼吸、发生庞大的膜系统、靠阳光光相助用发生能量等。
生态位区别
真核细胞由于细胞体积较大、代谢缓慢，顺应性较差，一样平常生涯于较温暖、湿润的情形中。它们尚有着更为庞大和多样化的生命流动，若有器官的动物、类脊动物和植物。
原核细菌具有无与伦比的顺应性，能够生涯在氧化或还原的情形下；生涯在温度、压力、ph 值等极端条件的情形中，如发生肠炎、霍乱的细菌、发生溃烂的特殊细菌等。
综上所述，真核细胞和原核细胞的差异很显著，但二者各具特色，都有自己在生命史上不行替换的作用。